|
UPT. PERPUSTAKAAN
Universitas Esa Unggul
Kampus Emas UEU - Jakarta Barat
|
Phone |
: |
021-5674223, ext 282 |
Fax |
: |
|
E-mail |
: |
[email protected] |
Website |
: |
http://library.esaunggul.ac.id
|
Support (Customer Service) :
|
[email protected] |
|
|
Welcome..guys!
|
Have a problem with your access?
Please, contact our technical support below:
|
LIVE SUPPORT
Astrid Chrisafi
|
! ATTENTION !
To facilitate the activation process, please fill out the member application form correctly and completely
Registration activation of our members will process up to max 24 hours (confirm by email). Please wait patiently
Still Confuse?
Please read our User Guide
|
|
UEU » Undergraduate Theses » Bioteknologi Posted by [email protected] at 02/08/2024 14:48:37 • 43 Views
OPTIMASI DETEKSI MULTIPLEX MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS (MDRTB)
DENGAN METODE REAL-TIME PCR (Q-PCR)Created by :
Farah Dianisa Surya ( 20190308001 )
Subject: | OPTIMASI DETEKSI MULTIPLEX MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS METODE REAL-TIME PCR | Alt. Subject : | OPTIMIZATION MULTIPLEX DETECTION MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS REAL-TIME PCR METHOD | Keyword: | Tuberkulosis MDR-TB gen katG gen rpoB Multiplex Real-Time
PCR |
Description:
Tuberkulosis adalah suatu penyakit menular yang disebabkan oleh kuman
pathogen Mycobacterium tuberculosis. Tuberkulosis (TB) masih menjadi masalah
kesehatan global. Adanya kasus MDR-TB membuat beban penyakit TB semakin
bertambah. MDR-TB merupakan suatu kejadian yang menyebabkan bakteri MTB
kebal terhadap OAT. MDR-TB merupakan masalah besar terhadap pencegahan dan
pemberantasan TB di dunia maupun di Indonesia. Metode pemeriksaan TB yang
masih menjadi baku emas saat ini memiliki banyak kelemahan antara lain waktu
pemeriksaan yang lama dan kesulitan membedakan sampel TB dan MDR-TB. Oleh
karna itu diperlukan metode alternatif yang dapat mendiagnosis TB dan MDR-TB
secara cepat, tepat dan akurat menggunakan Real-Time PCR (qPCR).
Tujuan dari penelitian ini adalah menguji keberhasilan desain probe multiplex
melalui metode qPCR dalam mendeteksi gen multiplex bakteri M. tuberculosis
pada sampel MDR-TB. Hasil penelitian akan memberikan informasi yang tepat
mengenai optimasi deteksi mutasi gen multiplex pada sampel pasien MDR-TB.
Pada penelitian ini digunakan probe gen multiplex M.tuberculosis yang telah
didesain untuk deteksi isolat DNA klinis dari sampel sputum pasien TB.
Sebelumnya telah dilakukan pengujian gen singleplex dengan cara
membandingkan validasi hasil SYBR dan Probe. Sampel klinis yang telah diuji
dengan SYBR memiliki hasil terbaik dipilih dan diuji coba ulang dengan qPCR
berbasis probe spesifik gen katG dan rpoB. Pengujian dengan probe sebagai
pembanding ini dapat menilai dan memvalidasi hasil yang lebih akurat mengenai
ketepatan dari primer yang telah di desain dalam mendeteksi keberadaan mutasi pada gen katG dan rpoB di sampel klinis. Didapatkan kurva amplifikasi yang
berbeda pada SYBR dan Probe dengan hasil yang muncul yaitu nilai Cq yang
berbeda dan terdapat kenaikan 2 puncak yang berbeda. Pasien yang diklasifikasikan
sebagai TB memiliki kurva yang diamplifikasi lebih awal dan plasmid TB
diamplifikasi lebih awal. Sedangkan pasien MDR-TB kurva diamplifikasi lebih
lambat dibandingkan kurva TB, hal ini menunjukkan bahwa nilai Cq pada TB lebih
rendah daripada nilai Cq MDR-TB.
Hasil optimasi qPCR menggunakan sampel pasien MDR-TB menunjukkan
nilai Cq yang tidak berbeda jauh antara TB dan MDR-TB dan dihasilkan suhu
annealing 60C. Keberhasilan amplifikasi qPCR menggunakan probe gen multiplex
(katG dan rpoB) menunjukkan bahwa desain probe telah spesifik mengamplifikasi
gen tersebut. Hasil statistik uji t-test unpaired menunjukkan bahwa tidak ada
perbedaan yang signifikan dari nilai Cq antara TB dan MDR-TB yang ditunjukkan
dengan nilai p value >0,05.
Tidak adanya perbedaan nilai Cq antara TB dan MDR-TB dikarenakan sampel
MDR-TB terlalu sedikit sehingga tidak cukup untuk mewakili pengujian dan
kemungkinan sampel yang diperoleh bukan sampel MDR-TB tetapi masih
tergolong sampel TB, sehingga diperlukan genome sequencing untuk memastikan
urutan genome yang dimiliki dan probe dari salah satu gen yaitu probe gen rpoB
terlalu pendek.
Contributor | : |
- Dr. TITTA NOVIANTI, S.Si, M.Biomed
| Date Create | : | 02/08/2024 | Type | : | Text | Format | : | PDF | Language | : | Indonesian | Identifier | : | UEU-Undergraduate-20190308001 | Collection ID | : | 20190308001 |
Source : Undergraduate Theses of Biotechnology
Relation Collection: Fakultas Ilmu-Ilmu Kesehatan
Coverage : Civitas Akademika Universitas Esa Unggul
Rights : @2024 Perpustakaan Universitas Esa Unggul
Publication URL : https://digilib.esaunggul.ac.id/optimasi-deteksi-multiplex-multidrug-resistant-tuberculosis-mdrtbdengan-metode-realtime-pcr-qpcr-34550.html
[ Free Download - Free for All ]
- UEU-Undergraduate-34550-COVER.Image.Marked.pdf - 432 KB
- UEU-Undergraduate-34550-HALAMAN PENGESAHAN.Image.Marked.pdf - 568 KB
- UEU-Undergraduate-34550-HALAMAN PERSETUJUAN PUBLIKASI.Image.Marked.pdf - 262 KB
- UEU-Undergraduate-34550-HALAMAN PERNYATAAN KEASLIAN.Image.Marked.pdf - 202 KB
- UEU-Undergraduate-34550-ABSTRAK.Image.Marked.pdf - 528 KB
- UEU-Undergraduate-34550-KATA PENGANTAR.Image.Marked.pdf - 500 KB
- UEU-Undergraduate-34550-DAFTAR ISI.Image.Marked.pdf - 359 KB
- UEU-Undergraduate-34550-DAFTAR TABEL.Image.Marked.pdf - 355 KB
- UEU-Undergraduate-34550-DAFTAR GAMBAR.Image.Marked.pdf - 361 KB
- UEU-Undergraduate-34550-DAFTAR PUSTAKA.Image.Marked.pdf - 479 KB
- UEU-Undergraduate-34550-BAB1.Image.Marked.pdf - 600 KB
[ FullText Content - Please, register first ]
1. UEU-Undergraduate-34550-BAB2.Image.Marked.pdf - 624 KB 2. UEU-Undergraduate-34550-BAB3.Image.Marked.pdf - 993 KB 3. UEU-Undergraduate-34550-BAB4.Image.Marked.pdf - 1172 KB 4. UEU-Undergraduate-34550-BAB5.Image.Marked.pdf - 470 KB 5. UEU-Undergraduate-34550-BAB6.Image.Marked.pdf - 427 KB
10 Similar Document...
No similar subject found !
10 Related Document...
|
POLLINGBagaimana pendapat Anda tentang repository kami ?
Visitors Today : 6
Total Visitor : 1969216
Hits Today : 55785
Total Hits : 140779995
Visitors Online: 1
Calculated since 16 May 2012
You are connected from 172.17.121.29 using Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; [email protected])
|