ANALISA BIOINFORMATIKA GEN E1 DAN E2 DARI VIRUS HEPATITIS C (HCV)GENOTIPE 1, 2, 3 DAN 6 SEBAGAI KANDIDAT VAKSIN VIRAL-LIKE PARTICLES (VLP)

Virus Hepatitis C (HCV) merupakan penyebab penyakit hepatitis. Penyakit ini cukup berbahaya dikarenakan besarnya angka penderita infeksi hepatitis kronis. Infeksi hepatitis kronis akan dapat berkembang menjadi sirosis dan kanker hati, hingga kematian. Angka kematian akibat kanker hati secara global cukup besar menyebabkan kanker hati menempati 10 besar penyebab kematian terbesar di dunia. Hal yang sama juga terjadi di Indonesia. Vaksin HCV sangat diperlukan untuk mencegah penularan infeksi HCV. Kesulitan yang dihadapi adalahbanyaknya genotipe HCV yang beredar di dunia. Di Indonesia sendiri terdapat genotipe 1, 2, 3 dan 6 yang beredar. Vaksin HCV harus mampu memberikan proteksi terhadap infeksi beberapa macam genotipe. Oleh karena itulah, pengembangan vaksin HCV memerlukan waktu yang cukup lama. Salah satu pendekatan vaksin yang dirasakan akan memberikan proteksi yang adekuat adalah dengan vaksin VLP (Viral-like Particles). Protein E1E2 yang terdapat pada permukaan virus merupakan kandidat yang sangat baik untuk dijadikan sebagai bahan vaksin VLP karena memiliki imunogenesitas yang tinggi. Dalam penelitian ini dilakukan analisa bioinformatika terhadap gen E1 dan E2 dari genotipe 1, 2, 3 dan 6. Sekuen-sekuen gen-gen inidiperoleh melalui GenBank dan dianalisa lebih lanjut menggunakan beberapa perangkat lunak seperti BioEdit Sequence Alignment Editor, BLAST dan Primer BLAST. Berhasil didapatkan sekuen konsensus gen E1-E2 yang bisa digunakan dalam penelitian lanjutan. Didapatkan juga sekuen lestari dari gen E1 dan E2. Diharapkan hasil penelitian ini dapat digunakan lebih lanjut dalam pengembangan kandidat vaksin VLP HCV.

1.  UEU-Research-9434-16_0058.pdf - 3494 KB