OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN KONSENTRASI PRIMER UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 MENGGUNAKAN PCR DAN REAL-TIME PCR

Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) adalah penyakit infeksi saluran pernapasan yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2. Virus tersebut pertama kali terdeteksi di Wuhan, China pada Desember 2019 dan telah menyebar ke seluruh dunia. Diagnosa molekuler COVID-19 yang saat ini dilakukan untuk mendeteksi virus penyebab COVID-19, SARS-CoV-19, yakni quantitative Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction(RT-qPCR). Dalam metode deteksi menggunakan PCR, primer merupakan komponen yang penting dalam menentukan akurasi sekuen DNA yang ingin diamplifikasi. Optimasi primer penting untuk mendapatkan produk PCR yang bagus tanpa kemungkinan memunculkan hasil positif atau negatif palsu. Pada kegiatan ini dilakukan optimasi kondisi primer hasil desain LIPI (LIPI_1, LIPI_5, dan LIPI_8) untuk deteksi SARS-CoV-2 dengan menggunakan metode PCR dan qPCR. Dari hasil penelitian diperoleh suhu annealing optimum untuk primer LIPI_1 dan LIPI_5 adalah 57 �C, untuk LIPI_8 adalah 60 �C. Konsentrasi yang optimal untuk primer LIPI_1 adalah 500 nM, untuk primer LIPI_5 dan LIPI_8 adalah 300 nM. Pada penelitian ini komposisi terbaik untuk deteksi COVID-19 adalah dengan menggunakan primer LIPI_1 pada suhu annealing 57 �C dan konsentrasi 500 nM. Dari hasil tersebut dapat dilanjutkan untuk pengembangan kit deteksi molekuler SARS-CoV-2 dengan menggunakan primer hasil desain LIPI guna percepatan penanganan COVID-19 di Indonesia.

1.  UEU-Undergraduate-30846-COVER.Image.Marked.pdf - 323 KB
2.  UEU-Undergraduate-30846-HALAMAN PENGESAHAN.Image.Marked.pdf - 351 KB
3.  UEU-Undergraduate-30846-HALAMAN PERSETUJUAN PUBLIKASI.Image.Marked.pdf - 420 KB
4.  UEU-Undergraduate-30846-HALAMA PERNYATAAN KEASLIAN.Image.Marked.pdf - 317 KB
5.  UEU-Undergraduate-30846-ABSTRAK.Image.Marked.pdf - 311 KB
6.  UEU-Undergraduate-30846-KATA PENGANTAR.Image.Marked.pdf - 309 KB
7.  UEU-Undergraduate-30846-DAFTAR ISI.Image.Marked.pdf - 760 KB
8.  UEU-Undergraduate-30846-DAFTAR PUSTAKA.Image.Marked.pdf - 568 KB
9.  UEU-Undergraduate-30846-BAB1.Image.Marked.pdf - 322 KB

• MODIFIKASI DETEKSI PIK3CA H1047R PASIEN KANKER PAYUDARA PADA MESIN REALTIME PCR CFX96
• OPTIMASI VOLUME KIT DA AN GENE UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 DENGAN REAL TIME RT-PCR
• OPTIMIZATION OF REAL-TIME PCR CONDITIONS FOR COVID-19 DIAGNOSIS WITH LOGIX SMART REAGENT�
• OPTIMASI KONDISI VOLUME REAL-TIME PCR UNTUK DIAGNOSIS COVID-19 DENGAN REAGEN LOGIX SMART
• OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN KONSENTRASI PRIMER UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 MENGGUNAKAN PCR DAN REAL-TIME PCR
• OPTIMASI REAKSI ONE-STEP REAL -TIME PCR (RT-PCR) TERHADAP GEN BCL-2 MANUSIA
• OPTIMIZATION OF DA AN GENE KIT FOR SARS-COV-2 DETECTION IN REAL-TIME RT-PCR
• HAK KEKAYAAN INTELEKTUAL PRODUK: SINGLEPLEX GEN DETEKSI TUBERCULOSIS MULTIDRUG RESISTEN DI INDONESIA MENGGUNAKAN REAGEN KIT RT-PCR
• OPTIMASI VOLUME KIT UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 DENGAN REAL TIME RT-PCR
• OPTIMASI DETEKSI MULTIPLEX MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS (MDRTB) DENGAN METODE REAL-TIME PCR (Q-PCR)