OPTIMASI VOLUME KIT DA AN GENE UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 DENGAN REAL TIME RT-PCR

SARS-CoV-2 adalah virus corona jenis baru dari genus Betacoronavirus dan famili Coronaviridae yang menyebabkan penyakit pernapasan yang disebut COVID-19. Virus ini memiliki selubung dan materi genetik berupa RNA rantai tunggal. Struktur genom dari virus ini dibagi menjadi dua jenis, yaitu gen yang menyandi protein non-struktural yang terdiri dari gen ORF1a/ORF1b dan gen yang mneyandi protein struktural yang terdiri dari spike glycoprotein (S), envelope (E), membrane glycoprotein (M), dan nucleocapsid protein (N). Metode deteksi SARS-CoV-2 dengan real time RT-PCR merupakan metode yang paling direkomendasikan dikarenakan memiliki spesifisitas dan keakuratan yang tinggi. Real time RT-PCR memerlukan pengambilan sampel dengan swab pada orofaring atau nasofaring untuk dilakukan pemeriksaan di laboratorium yang nantinya keberadaan RNA virus menjadi molekul yang dinilai untuk hasil diagnosis. Pada penelitian ini dilakukan optimasi volume pada kit Da An Gene yang digunakan untuk deteksi SARS-CoV-2 dengan Real time RT-PCR dengan tujuan untuk mengehemat penggunaan reagen dari kit yang tersedia namun dengan hasil amplifikasi tetap optimal dan akurat. Terdapat tiga sampel RNA SARS-CoV-2 yang digunakan yang terdiri dari sampel N62, N63, dan N79 dan tiga jenis total volume yang digunakan yaitu sebesar 20 μl, 15 μl, dan 10 μl. Hasil dari penelitian ini menujukkan bahwa ketiga sampel positif mengandung SARS-CoV-2 dengan nilai Cq < 40. Kemudian, dari ketiga volume yang diuji coba, didapatkan volume 20 μl merupakan volume yang optimal dikarenakan menghasilkan nilai Cq terkecil dibandingkan dua volume lainnya.

1.  UEU-Undergraduate-26869-COVER.Image.Marked.pdf - 211 KB
2.  UEU-Undergraduate-26869-HALAMAN PENGESAHAN.Image.Marked.pdf - 235 KB
3.  UEU-Undergraduate-26869-KATA PENGANTAR.Image.Marked.pdf - 220 KB
4.  UEU-Undergraduate-26869-DAFTAR ISI.Image.Marked.pdf - 228 KB
5.  UEU-Undergraduate-26869-DAFTAR PUSTAKA.Image.Marked.pdf - 290 KB
6.  UEU-Undergraduate-26869-LAMPIRAN.Image.Marked.pdf - 439 KB
7.  UEU-Undergraduate-26869-BAB1.Image.Marked.pdf - 278 KB

• MODIFIKASI DETEKSI PIK3CA H1047R PASIEN KANKER PAYUDARA PADA MESIN REALTIME PCR CFX96
• OPTIMASI VOLUME KIT DA AN GENE UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 DENGAN REAL TIME RT-PCR
• OPTIMIZATION OF REAL-TIME PCR CONDITIONS FOR COVID-19 DIAGNOSIS WITH LOGIX SMART REAGENT�
• OPTIMASI KONDISI VOLUME REAL-TIME PCR UNTUK DIAGNOSIS COVID-19 DENGAN REAGEN LOGIX SMART
• OPTIMASI SUHU ANNEALING DAN KONSENTRASI PRIMER UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 MENGGUNAKAN PCR DAN REAL-TIME PCR
• OPTIMASI REAKSI ONE-STEP REAL -TIME PCR (RT-PCR) TERHADAP GEN BCL-2 MANUSIA
• OPTIMIZATION OF DA AN GENE KIT FOR SARS-COV-2 DETECTION IN REAL-TIME RT-PCR
• HAK KEKAYAAN INTELEKTUAL PRODUK: SINGLEPLEX GEN DETEKSI TUBERCULOSIS MULTIDRUG RESISTEN DI INDONESIA MENGGUNAKAN REAGEN KIT RT-PCR
• OPTIMASI VOLUME KIT UNTUK DETEKSI SARS-COV-2 DENGAN REAL TIME RT-PCR
• OPTIMASI DETEKSI MULTIPLEX MULTIDRUG RESISTANT TUBERCULOSIS (MDRTB) DENGAN METODE REAL-TIME PCR (Q-PCR)